HIDROAMBIENTE C.A. cuenta con una organización de tipo matricial orientada a la ejecución de proyectos.
Así, cada estudio está bajo la responsabilidad directa de un Gerente de Proyecto, misión que es encomendada a un profesional de adecuada experiencia y capacitación según las necesidades planteadas por cada cliente. Este gerente, con la asistencia y la colaboración de los jefes de departamento, está en condiciones de poner a disposición de su proyecto los mejores recursos humanos y materiales en el momento requerido y con las calificaciones apropiadas para garantizar el éxito en la ejecución de los estudios y en la solución de los problemas planteados por el cliente.
Por otra parte, cada empleado está adscrito a una organización departamental por disciplinas dentro de la cual se le supervisa y da asistencia así como se asegura la calidad de los trabajos desarrollados por el personal asignado al proyecto.